V roce 1998 založila Nadace Sbírku současného českého umění, do níž svá díla věnovali přední čeští výtvarní umělci a dnes obsahuje 101 výtvarných děl.

Hodnota Sbírky, která tvořila až do roku 2002 jediné nadační jmění instituce byla vyčíslena na 2.745.000 Kč.

Poprvé byla Sbírka prezentována veřejnosti na výstavě Umění pro nemocnici v pražské Galerii Václava Špály počátkem roku 1999. Část sbírky, jejíž výběr provedl sám prezident Havel, byla pak následně zapůjčena k expozici v nově zrekonstruovaném ústředním pavilónu Vojenské nemocnice v Praze - Střešovicích.

V roce 2002 byla další část uměleckých děl Sbírky dlouhodobě zapůjčena do prostor Kanceláře Prezidenta republiky. Sbírka je stále doplňována a kromě toho, že je cennou součástí dokumentace současného českého umění, je také zdrojem částečného krytí nákladů nadace prostřednictvím poplatků soukromých společností ze zapůjčení děl.